蓝鲸新闻6月29日讯（记者屠俊）6月26日盘后，百济神州有限公司（以下简称“百济神州”，688235.SH）发布公告一家境内全资子公司于近日收到当地主管税务部门通知，公司同意对先前提交的纳税申报表进行若干调整。公司已就相关税务事项与主管税务部门完成确认，并将按要求及时补缴税款及滞纳金共计约人民币4.46亿元。值得注意的是，这个数字约为其2025年净利润的30%。
根据百济神州此前发布2025年年报。报告显示，公司2025年实现营业收入382.25亿元，同比增长40.46%；归母净利润为14.61亿元，同比由亏损49.78亿元转为盈利；扣非净利润为14.20亿元，同比由亏损53.79亿元转为盈利。
百济神州向蓝鲸新闻表示，公司近日收到地方主管税务部门对相关税务事项的通知，对前期提交的纳税申报表进行若干调整，就相关税务事项的技术性认定及税会处理差异与主管税务部门进行了充分、专业的沟通，并将按要求完成款项缴纳。本次事项不涉及行政处罚。基于企业会计准则相关规定判断，该事项不属于前期会计差错，不涉及前期财务数据追溯调整。
“预计计入2026年当期损益，对公司净利润的具体影响，最终以经审计的财务报表为准。本次事项预计不会对公司财务状况、持续经营能力及正常经营产生重大不利影响。”百济神州表示。
事实上，除了百济神州年内多家医药公司都突发大额补税。
5月20日上午，被业内称为“眼科茅”的爱尔眼科（300015.SZ）公告显示，公司根据相关法律法规要求开展涉税事项自查后，确认需补缴税款3.48亿元，并缴纳滞纳金1.76亿元，两项合计达5.24亿元。
1月1日，中国医药（600056.SH）公告称，其全资子公司三洋药业、康力药业收到税务通知，需合计补缴税款及滞纳金约6521.78万元，其中三洋药业补缴税款2148.62万元、滞纳金1074.29万元，康力药业补缴税款2128.26万元、滞纳金1170.61万元。
此外，嘉事堂（002462.SZ）、蓝帆医疗（002382.SZ）、重药控股（000950.SZ）等都发布了补税公告。
不止医药行业，据Wind数据不完全统计，截至6月25日，年内已有至少80家上市公司披露补税或涉税调整相关公告，逼近2025年全年89家的总量，累计涉及补缴税款、滞纳金及罚款超60亿元。
天牧创投生态发起人、泰和泰（上海）律师事务所高级合伙人桂辛律师向蓝鲸新闻表示，近期百济神州、爱尔眼科等医药上市公司在年报后相继补税，本质是金税四期强监管下，医药行业高研发投入、多元业务模式带来的税收优惠适用（如高新资质、研发加计扣除）、税会差异及关联交易等历史合规问题集中暴露；补税多发生在年报后，既是企业完成汇算清缴与审计后主动开展税务自查、规避稽查罚款的合规选择，也反映出审计侧重财务真实性、税务侧重税法适用的天然差异——补税通常属于政策口径调整而非财务造假，是资本市场税务合规常态化、“排雷”自纠的体现。
“今年医药等行业巨额补税频现且金额远超往年，核心在于金税四期全面落地实现了多部门数据穿透，叠加税收优惠严监管与《增值税法》实施，迫使企业不得不对过往五年甚至十年的历史税务隐患进行集中清算；与此同时，上市公司出于规避高额罚款及信披风险考虑，选择在年报审计与汇算清缴后主动“排雷”并公告，这种技术倒逼、政策收紧与主动合规的多重共振，使得往年隐蔽的存量问题在2026年集中爆发，形成了看似突增的补税潮。”桂辛律师认为。
这轮补税只涉及今年还是会形成常态化影响？
桂辛律师认为，这轮巨额补税并非仅限2026年当年，而是分为两层逻辑：2026年扎堆的大额补税主要是一次性集中清算多年（通常倒查3-5年）历史存量隐患（高新资质偏差、旧账税会差异等），随着主动自查推进，这类巨额追溯补税在未来1-2年内会逐步减少；但常态化税务调整将长期存在——金税四期“以数治税”是永久基建，税收优惠严监管（高新年审、研发加计扣除实时复核）成常态，未来企业每年汇算清缴仍可能因政策口径细化、关联交易定价调整产生补税，只是金额会回归常规量级，不再出现集中“天价旧账”清算，税务合规将从偶然的“排雷事件”固化为企业日常刚性经营成本。
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